バニラエア（Vanilla Air）での航空券予約は、便利でおトクな公式ホームページからの手続きが一般的になっていますが、インターネット環境が整っていない人やパソコンが苦手な人向けに、電話による予約センターを設けています。
予約センターの電話番号：0570-6666-03
（受付時間：月曜日～金曜日の10時～18時。祝祭日、年末年始は除く。）
※日本語で対応。
予約センターでは航空券の予約・変更・解約・払い戻しなど各種問い合わせに対応しています。通話料は有料です。また、予約センターからの予約には1,000円（1人1対応ごとに）かかります。10名以上の団体予約は団体予約専用窓口（メール問い合わせ）で受け付けています。
団体予約専用窓口：vanilla-grp@bigs.co.jp
（受付時間：月曜日～金曜日の10時～18時。祝祭日、年末年始は除く。）
航空券の購入期限は国内線が出発時刻の40分前まで、国際線が出発時刻の60分前まで。それ以降の予約は受け付けていません。